1、科學(xué)事業(yè)費
　　科學(xué)事業(yè)費按照《預(yù)算法》和《科學(xué)事業(yè)單位財務(wù)制度》、《科學(xué)事業(yè)單位會計制度》的要求進(jìn)行財務(wù)管理與會計核算。
　?。?）財政預(yù)算管理政策
　　國家對科學(xué)事業(yè)單位實行核定收支、定額或者定項補助、超支不補、結(jié)余留用的預(yù)算管理辦法。
　　國家根據(jù)科技事業(yè)發(fā)展計劃和科學(xué)事業(yè)單位特點、財務(wù)收支狀況、承擔(dān)國家科技任務(wù)情況以及國家財政政策和財力可能，按照“盤活存量，增量調(diào)節(jié)； 分類指導(dǎo)，重點支持”的原則,對單位實行定額或者定項補助的管理辦法。
　　對主要從事理論研究、基礎(chǔ)研究和社會公益研究的單位，以及國家賦予專業(yè)服務(wù)和管理職能的單位，實行定額或者定項補助。
　　對主要從事技術(shù)開發(fā)研究和科技服務(wù)的單位，實行定項補助，定項補助可以為零。
　　（2）預(yù)算編制內(nèi)容
　　科學(xué)事業(yè)單位預(yù)算由收入預(yù)算和支出預(yù)算組成。收入預(yù)算包括財政補助收入、上級補助收入、事業(yè)收入、經(jīng)營收入、附屬單位上繳收入和其他收入。支出預(yù)算包括事業(yè)支出、經(jīng)營支出、自籌基本建設(shè)支出，對附屬單位補助支出和上繳上級支出。單位預(yù)算必須全面反映單位的收入和支出內(nèi)容。
　?。?）預(yù)算編制和審批程序
　　科學(xué)事業(yè)單位根據(jù)事業(yè)發(fā)展計劃提出預(yù)算建議數(shù)，經(jīng)財務(wù)主管部門審核匯總報科技部,由科技部統(tǒng)一報財政部門核定預(yù)算控制數(shù)。單位根據(jù)科技部下達(dá)的預(yù)算控制數(shù)編制單位預(yù)算，由財務(wù)主管部門匯總報科技部審核批復(fù)執(zhí)行。
　?。?）預(yù)算調(diào)整
　　科學(xué)事業(yè)單位預(yù)算在執(zhí)行過程中，國家對財政補助收入和從財政專戶核撥的預(yù)算外資金一般不予調(diào)整。當(dāng)上級下達(dá)的事業(yè)計劃有較大調(diào)整，或者根據(jù)國家有關(guān)政策增加或者減少支出，對預(yù)算執(zhí)行影響較大時，單位可以報請財務(wù)主管部門或者財政部門調(diào)整預(yù)算。其余收入部分需要調(diào)增或者調(diào)減的，由單位自行調(diào)整，并報財務(wù)主管部門和財政部門備案。
　　單位收入預(yù)算調(diào)整后，相應(yīng)調(diào)增或者調(diào)減支出預(yù)算。
　　2、國家重點基礎(chǔ)研究專項經(jīng)費
　　國家重點基礎(chǔ)研究專項經(jīng)費預(yù)算的申報審批程序：
　?。ㄒ唬┯心芰?、有條件承擔(dān)項目的單位和科學(xué)家按照項目申報書的統(tǒng)一要求編制項目經(jīng)費　　　預(yù)算，與申報書一起向科技部申報；
　?。ǘ┛萍疾拷M織專家對評審入選項目的經(jīng)費預(yù)算提出初步意見；
　?。ㄈ┛萍疾繉υu審入選項目的經(jīng)費預(yù)算進(jìn)行審議，并將結(jié)果公開征求意見；
　　（四）科技部在公開征求意見后，根據(jù)反饋的意見，對項目預(yù)算進(jìn)行復(fù)議，并將入選項目　　　的經(jīng)費預(yù)算和專項經(jīng)費的年度總預(yù)算報財政部審批。
　　3、科學(xué)科技三項費用
　　科技部歸口管理的科學(xué)科技三項費用（簡稱科技三項費用）由科技部提出項目計劃并會同財政部聯(lián)合下達(dá)?？萍既椯M用應(yīng)按規(guī)定程序辦理劃撥手續(xù)，并及時足額劃撥到項目承擔(dān)單位?？萍既椯M用的管理應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行財工字［1996］44號文件印發(fā)的《科技三項費用管理辦法（試行）》。
　?。?）科技三項費用原則上實行合同化管理，經(jīng)費包干、?？顚Ｓ茫瑖?yán)禁截留、挪用?？萍既椯M用必須用于科技項目的研究開發(fā)及其科技計劃的實施，不得用于研究開發(fā)課題以外的會議、編書、期刊、調(diào)研等工作以及支持機構(gòu)的經(jīng)常性運行和經(jīng)營性活動。
　?。?）科技三項費用的開支范圍包括：設(shè)備購置費，能源材料費，試驗外協(xié)費，資料費，印刷費，租賃費，差旅費，鑒定費，驗收費，管理費，其他費用。
　?。?）科技三項費用應(yīng)嚴(yán)格按項目進(jìn)行核算管理，建立預(yù)算和決算管理制度。在項目的立項和驗收過程中，各級項目主管部門要加強科技三項費用的預(yù)算和決算的規(guī)范化管理，各級財政、財務(wù)部門應(yīng)及時了解項目的立項和鑒定、驗收等情況，認(rèn)真把好項目經(jīng)費的預(yù)、決算關(guān)。
　　（4）因特殊原因，需要中途撤銷或更改的科技三項費用項目，在項目主管部門做出撤銷或更改項目的決定后一個月內(nèi)，項目承擔(dān)單位必須作出經(jīng)費決策，連同固定資產(chǎn)購置情況一并報送項目主管部門和原撥款財政部門核批，剩余的科技三項費用應(yīng)全額上繳原撥款財政部門，由原項目主管部門繼續(xù)用于安排國家重點科技項目計劃。
　?。?）任何單位或個人不得以任何形式、任何理由截留或挪用科技三項費用。對違反規(guī)定的，一經(jīng)查出，要追究有關(guān)人員的責(zé)任，將截留或挪用經(jīng)費全額收繳國家財政，并停撥或核減以后年度的科技三項費用指標(biāo)。
　　4、高技術(shù)研究專項經(jīng)費
　　高技術(shù)研究專項經(jīng)費（簡稱八六三計劃經(jīng)費）的管理應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行（93）財文字第822號文件印發(fā)的《八六三計劃經(jīng)費管理暫行辦法》。
　　（1）八六三計劃經(jīng)費由中央財政預(yù)算單列，專項撥款。用款單位須?？顚Ｓ?，單獨核算，不得以任何名義截留、挪用或擠占。
　?。?）八六三計劃經(jīng)費的管理工作，由主管部門統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)，實行分級歸口管理；各級專家組織(包括領(lǐng)域?qū)＜椅瘑T會、主題專家組、專題組)具體負(fù)責(zé)相關(guān)經(jīng)費的管理工作；承擔(dān)八六三計劃的單位應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行國家有關(guān)財經(jīng)法規(guī)，合理有效使用經(jīng)費。
　?。?）八六三計劃經(jīng)費實行經(jīng)費與任務(wù)掛鉤。安排、使用經(jīng)費，要兼顧需要和可能，貫徹量入為出、勤儉節(jié)約、精打細(xì)算的原則，使有限的經(jīng)費發(fā)揮更大的效益，確保計劃任務(wù)的完成。
　?。?）八六三計劃經(jīng)費包括項目經(jīng)費、計劃管理費和計劃調(diào)整費。
　　①項目經(jīng)費指用于項目(課題)研究開發(fā)過程中所必需的經(jīng)費。項目經(jīng)費核算設(shè)置以下科目：設(shè)備購置費、業(yè)務(wù)費、公務(wù)費、修繕費、科研管理費、其他費用和結(jié)余經(jīng)費留成。
　?、谟媱澒芾碣M指主要用于領(lǐng)域?qū)＜椅瘑T會(含未設(shè)專家委員會的主題專家組)為管理八六三計劃所支出的費用。計劃管理費核算設(shè)置以下科目：設(shè)備購置費、業(yè)務(wù)費、公務(wù)費、修繕費和其他費用。
　?、塾媱澱{(diào)整費是指由主管部門分別掌握并用于計劃執(zhí)行中臨時調(diào)整項目或已定項目由于工作內(nèi)容增加所需的機動經(jīng)費。八六三計劃不得用于各項罰款、捐款、贊助支出，投資支出，以及國家規(guī)定不得列入的其他支出。
　　（5）經(jīng)費預(yù)算由主題專家組、領(lǐng)域?qū)＜椅瘑T會和主管部門根據(jù)中長期發(fā)展計劃、上年度項目進(jìn)展情況和本年度任務(wù)，按撥款渠道和規(guī)定的編報要求，逐級審核、編列匯總，上報財政部審批后，再逐級下達(dá)執(zhí)行。經(jīng)費預(yù)算一經(jīng)批準(zhǔn)，要嚴(yán)格執(zhí)行，一般不作調(diào)整；如有必要調(diào)整時，應(yīng)按規(guī)定程序上報審批。
　?。?）對于弄虛作假、截留、挪用、擠占八六三計劃經(jīng)費等違反財經(jīng)紀(jì)律的行為，采取通報批評、停止撥款、終止項目等措施；情節(jié)嚴(yán)重者，提交有關(guān)部門追究單位和有關(guān)人員的責(zé)任；觸犯法律的，應(yīng)追究有關(guān)法律責(zé)任。
　　5、科技外事經(jīng)費
　　科技部各種外事經(jīng)費的使用嚴(yán)格按照中華人民共和國財政部外匯外事司編撰的《外事財務(wù)規(guī)章制度匯編》中的各種規(guī)章制度。
　　科技部外事經(jīng)費的開支范圍包括：駐外機構(gòu)經(jīng)費、出國費、招待費，根據(jù)國務(wù)院批準(zhǔn)的計劃向一些國際組織的捐贈支出，由我部執(zhí)行的對外科技合作項目支出等。
　　外事經(jīng)費單獨核算，不得改變資金的性質(zhì)和用途，不得挪用或擠占，外事經(jīng)費使用計劃的安排應(yīng)遵循“統(tǒng)籌兼顧，保證重點”的原則，不得突破確定的預(yù)算指標(biāo)。科技部外事經(jīng)費不得以任何名義補助地方，也不得用于基建投資及設(shè)備購置修繕等支出。
　　6、基本建設(shè)經(jīng)費
　　基建經(jīng)費的管理應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行《中華人民共和國預(yù)算實施條例》及國家基本建設(shè)投資的有關(guān)規(guī)定。
　　基建非經(jīng)營性基金的開支范圍包括建筑安裝工程費用，設(shè)備購置費，工具、器具及生產(chǎn)用具購置費，其他基本建設(shè)費。國家對基建總規(guī)模實行嚴(yán)格控制，各種資金渠道安排的基建都要納入計劃管理范圍。嚴(yán)格基建項目審批制度，基建項目計劃一經(jīng)確定不得任意變更（包括建設(shè)規(guī)模、建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)），否則需按原規(guī)定程序重新審批。更不得上計劃外基建項目。國撥基建投資的管理應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行《中華人民共和國預(yù)算法實施條例》及國家計委、財政部、中國建設(shè)銀行的有關(guān)規(guī)定，實行專款專用 。
　　7、科研院所技術(shù)開發(fā)研究專項資金
　?。?） 專項資金的支持方向
　　專項資金主要用于支持中央級技術(shù)開發(fā)型科研機構(gòu)（包括1999年以后轉(zhuǎn)制的原中央級技術(shù)開發(fā)型科研機構(gòu)）以開發(fā)高新技術(shù)產(chǎn)品或工程技術(shù)為目標(biāo)的應(yīng)用開發(fā)研究工作。專項資金采取項目支持的方式。
　?。?） 專項資金的支出范圍
　　專項資金的支出范圍包括項目費和管理費。
　?。?） 項目的申報條件
　　項目必須符合國家科技產(chǎn)業(yè)政策和專項資金的支持方向并經(jīng)過充分論證；項目承擔(dān)單位必須匹配項目計劃投入30%以上的自籌資金，并首先落實資金來源； 項目承擔(dān)單位應(yīng)為項目提供必需的條件。
　?。?） 項目的申報和審批程序
　　a) 申報單位應(yīng)于每年6月底之前向科技部申報項目，并提供項目申報書、項目可行性研究報告、項目預(yù)算書、項目承擔(dān)單位上年度財務(wù)報告等材料。
　　b) 科技部對申報單位和申報項目進(jìn)行資格審查。
　　c) 科技部、財政部將通過資格審查的項目委托指定的中介機構(gòu)進(jìn)行技術(shù)經(jīng)濟評估，并對項目預(yù)算進(jìn)行評估。
　　d) 科技部、財政部根據(jù)項目評估情況進(jìn)行綜合審評，確定當(dāng)年專項資金支持項目和支持額度。
　　e) 經(jīng)批準(zhǔn)的項目及其預(yù)算一般不作調(diào)整。
　?。?） 監(jiān)督與檢查
　　科技部、財政部將組織對專項資金的使用與管理情況進(jìn)行定期或不定期的監(jiān)督檢查；項目承擔(dān)單位的財務(wù)部門對專項資金的使用與管理情況要進(jìn)行經(jīng)常性的監(jiān)督檢查；對弄虛作假、截留、挪用和擠占專項資金等違反財務(wù)制度和財經(jīng)紀(jì)律的行為，除按照有關(guān)規(guī)定對項目承擔(dān)單位和責(zé)任人給予行政和經(jīng)濟處罰外，科技部還將收回部分或全部資金，并根據(jù)情況采取取消申報單位以后年度的專項資金申報資格等措施；項目因故中止，科技部將根據(jù)具體情況收回部分或全部資金。
　　8、學(xué)術(shù)著作出版基金
　　學(xué)術(shù)著作出版基金的管理應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行國科發(fā)財字［1997］104號文件印發(fā)的《國家科學(xué)技術(shù)學(xué)術(shù)著作出版基金管理辦法》。
　?。?）學(xué)術(shù)著作出版基金由國家科學(xué)技術(shù)著作出版基金委員會管理。
　　（2）學(xué)術(shù)著作出版基金主要來源。
　　國家財政專項補助；各級政府部門、單位、社會團體和個人的贊助或捐贈；存款利息及各利收益；受資助的專著出版后的盈利上交部分；其他收入。
　?。?）學(xué)術(shù)著作出版基金全額存入指定的國有銀行，每年的資助金總額和評審管理費以當(dāng)年基金利息為限。
　　（4）學(xué)術(shù)著作出版基金資助用于彌補受資助的學(xué)術(shù)著作在出版過程中所發(fā)生直接費用的不足部分。科技出版資助項目的資助金額最高不超過10萬元。
　?。?）學(xué)術(shù)著作出版基金本息不得用于購買股票、風(fēng)險債券，以及進(jìn)行生產(chǎn)經(jīng)營和房地產(chǎn)等風(fēng)險性投資。
　　（6）學(xué)術(shù)著作出版基金資助范圍。
　　學(xué)術(shù)專著、基礎(chǔ)理論著作、應(yīng)用技術(shù)著作、暫不得用于譯著、論文集、科普讀物、教科書、工具書。
　　（7）學(xué)術(shù)著作出版基金管理程序。
　　申請者向出版基金委辦公室提出申請；出版基金委辦公室進(jìn)行形式審查；評審機構(gòu)進(jìn)行評審；出版基金委審定。